IndietroAutore: Costantini Irene 1) Fiber enhancement and 3D orientation analysis in label-free two-photon fluorescence microscopy in SCIENTIFIC REPORTSDi: Sorelli Michele; Costantini Irene; Bocchi Leonardo; Axer Markus; Pavone Francesco Saverio; Mazzamuto Giacomo Anno: 2023 (Cit.: 0 DOI: 10.1038/s41598-023-30953-w)
2) 3D molecular phenotyping of cleared human brain tissues with light-sheet fluorescence microscopy in COMMUNICATIONS BIOLOGYDi: Pesce Luca; Scardigli Marina; Gavryusev Vladislav; Laurino Annunziatina; Mazzamuto Giacomo; Brady Niamh; Sancataldo Giuseppe; Silvestri Ludovico; Destrieux Christophe; Hof Patrick R.; Costantini Irene; Pavone Francesco S. Anno: 2022 (Cit.: 0 DOI: 10.1038/s42003-022-03390-0)
3) Autofluorescence enhancement for label‑free imaging of myelinated fibers in mammalian brains in SCIENTIFIC REPORTSDi: Costantini I., Baria E., Sorelli M., Matuschke F., Giardini F., Menzel M., Mazzamuto G., Silvestri L., Cicchi R., Amunts K., Axer M., Pavone F.S. Anno: 2021 (Cit.: 15 DOI: 10.1038/s41598-021-86092-7)
4) Comparison of Different Tissue Clearing Methods for Three-Dimensional Reconstruction of Human Brain Cellular Anatomy Using Advanced Imaging Techniques in FRONTIERS IN NEUROANATOMYDi: Scardigli M., Pesce L., Brady N., Mazzamuto G., Gavryusev V., Silvestri L., Hof PR., Destrieux C., Costantini I., Pavone FS. Anno: 2021 (Cit.: 0 DOI: 10.3389/fnana.2021.752234)
5) Large-scale, cell-resolution volumetric mapping allows layer-specific investigation of human brain cytoarchitecture in BIOMEDICAL OPTICS EXPRESSDi: Costantini I., Mazzamuto G., Roffilli M., Laurino A., Castelli FM., Neri M., Lughi G., Simonetto A., Lazzeri E., Pesce L., Destrieux C., Silvestri L., Conti V., Guerrini R., Pavone FS Anno: 2021 (Cit.: 11 DOI: 10.1364/BOE.415555)
6) Universal autofocus for quantitative volumetric microscopy of whole mouse brains in NATURE METHODSDi: Silvestri L., Mullenbroich MC., Costantini I., Di Giovanna AP., Mazzamuto G., Franceschini A., Kutra D., Kreshuk A., Checcucci C., Toresano LO., Frasconi P., Sacconi L., Pavone FS. Anno: 2021 (Cit.: 23 DOI: 10.1038/s41592-021-01208-1)
7) Exploring the human cerebral cortex using confocal microscopy in PROGRESS IN BIOPHYSICS & MOLECULAR BIOLOGYDi: Pesce Luca; Laurino Annunziatina; Scardigli Marina; Yang Jiarui; Boas David A.; Hof Patrick R.; Destrieux Christophe; Costantini Irene; Pavone Francesco Saverio Anno: 2021 (Cit.: 8 DOI: 10.1016/j.pbiomolbio.2021.09.001)
8) Towards a clearer view of sympathetic innervation of cardiac and skeletal muscles in PROGRESS IN BIOPHYSICS & MOLECULAR BIOLOGYDi: Di Bona A., Vita V., Costantini I., Zaglia T. Anno: 2020 (Cit.: 18 DOI: 10.1016/j.pbiomolbio.2019.07.003)
9) Dissecting Neuronal Activation on a Brain-Wide Scale With Immediate Early Genes in FRONTIERS IN NEUROSCIENCEDi: Franceschini A., Costantini I., Pavone FS., Silvestri L. Anno: 2020 (Cit.: 18 DOI: 10.3389/fnins.2020.569517)
10) 3D imaging and morphometry of the heart capillary system in spontaneously hypertensive rats and normotensive controls in SCIENTIFIC REPORTSDi: Olianti C., Costantini I., Giardini F., Lazzeri E., Crocini C., Ferrantini C., Pavone FS., Camici PG., Sacconi L. Anno: 2020 (Cit.: 12 DOI: 10.1038/s41598-020-71174-9)
11) Toward a High-Resolution Reconstruction of 3D Nerve Fiber Architectures and Crossings in the Brain Using Light Scattering Measurements and Finite-Difference Time-Domain Simulations in PHYSICAL REVIEW XDi: Menzel M., Axer M., De Raedt H., Costantini I., Silvestri L., Pavone FS., Amunts K., Amunts K., Michielsen K. Anno: 2020 (Cit.: 13 DOI: 10.1103/PhysRevX.10.021002)
12) In-vivo and ex-vivo optical clearing methods for biological tissues: review in BIOMEDICAL OPTICS EXPRESSDi: Costantini I., Cicchi R., Silvestri L., Vanzi F., Pavone F.S. Anno: 2019 (Cit.: 96 DOI: 10.1364/BOE.10.005251)
13) Cardiac sympathetic innervation network shapes the myocardium by locally controlling cardiomyocyte size through the cellular proteolytic machinery in JOURNAL OF PHYSIOLOGY-LONDONDi: Pianca N., Di Bona A., Lazzeri E., Costantini I., Franzoso M., Prando V., Armani A., Rizzo S., Fedrigo M., Angelini A., Basso C., Pavone FS., Rubart M., Sacconi L., Zaglia T., Mongillo M. Anno: 2019 (Cit.: 32 DOI: 10.1113/JP276200)
14) Whole-Brain Vasculature Reconstruction at the Single Capillary Level (vol 8, 12573, 2018) in SCIENTIFIC REPORTSDi: Di Giovanna AP., Tibo A., Silvestri L., Mullenbroich MC., Costantini I., Allegra Mascaro AL., Sacconi L., Frasconi P., Pavone FS. Anno: 2019 (Cit.: 0 DOI: 10.1038/s41598-019-42216-8)
15) Three-dimensional analysis of human brain cytoarchitectonics by means of a SWITCH/TDE-combined clearing method Di: Costantini I., Mazzamuto G., Laurino A., Lazzari E., Sacconi L., Neri M., Simonetto A., Ruffilli M., Silvestri L., Pavone FS. Anno: 2019 (Cit.: 0)
16) Whole-Brain Vasculature Reconstruction at the Single Capillary Level in SCIENTIFIC REPORTSDi: Di Giovanna A.P., Tibo A., Silvestri L., Muellenbroich M.C., Costantini I., Allegra Mascaro A.L., Sacconi L., Frasconi P., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 77 DOI: 10.1038/s41598-018-30533-3)
17) Whole heart cytoarchitecture at sub-cellular resolution Di: Lazzeri E., Costantini I., Cannazzaro S., Ferrantini C., Mazzamuto G., Crocini C., Cerbai E., Poggesi C., Pavone FS., Sacconi L. Anno: 2018 (Cit.: 0)
18) High-fidelity imaging in brain-wide structural studies using light-sheet microscopy in ENEURODi: Müllenbroich M.C., Silvestri L., Di Giovanna A.P., Mazzamuto G., Costantini I., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 11 DOI: 10.1523/ENEURO.0124-18.2018)
19) Towards a full volumetric atlas of cell-specific neuronal spatial organization in the entire mouse brain Di: Silvestri L., Di Giovanna A.P., Mazzamuto G., Leergard T., Orsini F., Costantini I., Bjaalie J., Frasconi P., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 0)
20) Software tools for efficient processing of high-resolution 3D images of macroscopic brain samples Di: Mazzamuto G., Silvestri L., Costantini I., Orsini F., Roffilli M., Frasconi P., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 0)
21) 3D human brain digital istopatology Di: Costantini I., Mazzamuto G., Silvestri L., Neri M., Roffilli M., Conti V., Guerrini R., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/BRAIN.2018.BF4C.1)
22) Automatic Segmentation of Neurons in 3D Samples of Human Brain Cortex Di: Mazzamuto G., Costantini I., Neri M., Roffilli M., Silvestri L., Pavone F.S. Anno: 2018 (Cit.: 0)
23) Correlative polarized light imaging and two-photon fluorescence microscopy for 3D myelinated fibers reconstruction Di: Costantini I., Menzel M., Silvestri L., Schubert N., Axer M., Amunts K., Pavone F.S. Anno: 2017 (Cit.: 0)
24) Fast, image-based autofocus system for high-resolution optical microscopy of whole mouse brains Di: Silvestri L., Müllenbroich M.C., Costantini I., Di Giovanna A.P., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2017 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/BODA.2017.JTu4A.8)
25) Optimal staining and clearing protocol for whole mouse brain vasculature imaging with light-sheet microscopy Di: Di Giovanna A.P., Tibo A., Silvestri L., Muellenbroich M.C., Costantini I., Sacconi L., Frasconi P., Pavone F.S. Anno: 2017 (Cit.: 0)
26) Clearing of fixed tissue: a review from a microscopist´s perspective in JOURNAL OF BIOMEDICAL OPTICSDi: Silvestri L., Costantini I., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2016 (Cit.: 101 DOI: 10.1117/1.JBO.21.8.081205)
27) Towards automated neuron tracing via global and local 3D image analysis Di: Acciai L., Costantini I., Pavone F.S., Conti V., Guerrini R., Soda P., Iannello G. Anno: 2016 (Cit.: 0)
28) Combination of two-photon fluorescence microscopy and label-free near-infrared reflectance: A new complementary approach for brain imaging Di: Costantini I., Mascaro A.L.A., Margoni E., Iannello G., Bria A., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2016 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/CANCER.2016.JW3A.23)
29) Label-free near-infrared reflectance microscopy as a complimentary tool for two-photon fluorescence brain imaging in BIOMEDICAL OPTICS EXPRESSDi: Allegra Mascaro A.L., Costantini I., Margoni E., Iannello G., Bria A., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 13 DOI: 10.1364/BOE.6.004483)
30) A versatile clearing agent for multi-modal brain imaging in SCIENTIFIC REPORTSDi: Costantini I., Ghobril J.P., Di Giovanna A.P., Allegra Mascaro A. L., Silvestri L., Müllenbroich M.C., Onofri L., Conti V., Vanzi F., Sacconi L., Guerrini R., Markram H., Iannello G., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 180 DOI: 10.1038/srep09808)
31) Comprehensive optical and data management infrastructure for high-throughput light-sheet microscopy of whole mouse brains in NEUROPHOTONICSDi: Muellenbroich M.C., Silvestri L., Onofri L., Costantini I., Van’t Hoff M., Sacconi L., Iannello G., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 17 DOI: 10.1117/1.NPh.2.4.041404)
32) A versatile clearing agent for multi modal brain imaging in SCIENTIFIC REPORTSDi: Costantini I., Ghobril JP, Di Giovanna AP, Allegra Mascaro AL, Silvestri L, Mllenbroich MC, Onofri L, Conti V, Vanzi F, Sacconi L, Guerrini R, Markram H, Iannello G, Pavone FS Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1038/srep09808)
33) Computer-based automatic identification of neurons in gigavoxel-sized 3D human brain images Di: Soda P., Acciai L., Cordelli E., Costantini I., Sacconi L., Pavone F.S., Conti V., Guerrini R., Frasconi P., Iannello G. Anno: 2015 (Cit.: 0)
34) Whole brain optical imaging Di: Silvestri L., Allegra Mascaro A.L., Costantini I., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2087339)
35) A multi modal clearing method for brain imaging Di: Costantini I., Mascaro A.L.A., Di Giovanna A.P., Silvestri L., Müllenbroich M.C., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/BRAIN.2015.BrM3B.2)
36) A new versatile clearing method for brain imaging Di: Costantini I., Di Giovanna A.P., Allegra Mascaro A.L., Silvestri L., Müllenbroich M.C., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2076908)
37) Multiphoton microscopy in brain imaging Di: Allegra Mascaro A.L., Silvestri L., Costantini I., Sacconi L., Maco B., Knott G.W., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2084183)
38) A versatile new technique to clear mouse and human brain Di: Costantini I., Di Giovanna A.P., Mascaro A.L.A., Silvestri L., Müllenbroich M.C., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2184289)
39) Brain-wide charting of neuronal activation maps with cellular resolution Di: Silvestri L., Rudinskiy N., Paciscopi M., Müllenbroich M.C., Costantini I., Sacconi L., Frasconi P., Hyman B.T., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1364/BRAIN.2015.BrM3B.6)
40) Brain imaging from the nano- to the macro-scale Di: Silvestri L., Allegra Mascaro A.L., Costantini I., Sacconi L., Pavone F.S. Anno: 2015 (Cit.: 0 DOI: 10.1109/NER.2015.7146760)
41) Gene polymorphisms in pattern recognition receptors and susceptibility to idiopathic recurrent vulvovaginal candidiasis in FRONTIERS IN MICROBIOLOGYDi: Rosentul D.C., Delsing C.E., Jaeger M., Plantinga T.S., Oosting M., Costantini I., Venselaar H., Joosten L.A.B., van der Meer J.W.M., Dupont B., Kullberg B.-J., Sobel J.D., Netea M.G. Anno: 2014 (Cit.: 0 DOI: 10.3389/fmicb.2014.00483)
42) Micron-scale Resolution Optical Tomography of Entire Mouse Brains with Confocal Light Sheet Microscopy in JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTSDi: Silvestri L., Bria A., Costantini I., Sacconi L., Peng H., Iannello G., Pavone F.S. Anno: 2013 (Cit.: 17 DOI: 10.3791/50696)
43) Neural plasticity explored by correlative two-photon and electron/spim microscopy Di: Mascaro A.L.Allegra, Silvestri L., Costantini I., Sacconi L., Maco B., Knott G.W., Pavone F.S. Anno: 2013 (Cit.: 0 DOI: 10.1117/12.2032505)
44) A promoter polymorphism in human interleukin-32 modulates its expression and influences the risk and the outcome of epithelial cell-derived thyroid carcinoma in CARCINOGENESISDi: Plantinga T.S., Costantini I., Heinhuis B., Huijbers A., Semango G., Kusters B., Netea M.G., Hermus A.R.M.M., Smit J.W.A., Dinarello C.A., Joosten L.A.B., Netea-Maier R.T. Anno: 2013 (Cit.: 32 DOI: 10.1093/carcin/bgt092)